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    R0 pour déterminer la propagation de la maladie

    Parfois, une maladie se propage comme un feu de forêt. Certains non. Certaines maladies disparaissent tout simplement. Comment pouvons-nous déterminer quelles maladies vont se propager et lesquelles ne le seront pas??
    Eh bien, il y a un terme pour cela, R0, prononcé R "Naught". Imaginez une classe de 1ère année. On arrive à l'école malade. 
    La maladie de cet enfant malade infecte un autre enfant. Le deuxième enfant pourrait alors infecter un enfant; le troisième enfant pourrait en infecter un autre. Une chaîne d'infections pourrait propager la maladie dans toute la classe.
    En épidémiologie, c’est ce que nous appelons une maladie avec un R0 de 1. Chaque cas entraîne un nouveau cas..

    Définition

    R0 est le nombre de reproduction de base. Il décrit le nombre d'enfants qui tomberont malades lorsqu'un enfant malade entrera dans la classe (la population) et que tous les enfants pourront tomber malades (ils sont susceptibles). Cela dépend à la fois de la maladie elle-même et des interactions des enfants.
    Lorsque les R0 sont supérieurs à 1, plus d'enfants sont infectés. Un R0 élevé n'est pas une maladie plus dangereuse. Un rhume peut avoir un R0 élevé; une maladie rare mais mortelle peut avoir une valeur faible, moins de 1. 
    Maintenant de retour en classe.

    R0 <1

    Imaginez qu'en moyenne, tous les enfants n'infectent pas un autre enfant. Le premier enfant infecte un deuxième; le second, un troisième. Cependant, peut-être que le troisième n'infecte aucun. 
    La maladie cesserait de se propager.
    C’est ce qui se produit lorsque R0 est inférieur à 1. Les enfants peuvent tomber malades au début, mais la maladie s’épuisera.

    R0> 1

    Revenons au premier enfant, imaginons maintenant que cet enfant en infecte 2, ces 2 enfants en infectent 2 chacun (4 ensemble). Au total, 7 seraient infectés. Les 4 derniers pourraient alors infecter 2 chacun, conduisant à 15 infections au total. Bientôt, il y aurait beaucoup d'enfants malades. C'est ce qui se produit lorsque R0 est égal à 2 et qu'aucun enfant malade n'est retenu à la maison..

    Susceptibilité

    Dans la vraie vie, tout le monde n'est pas capable d'attraper le virus. Certains enfants peuvent être vaccinés. Certains vont tomber malades et ne peuvent pas tomber malades deux fois en même temps. Certains enfants seront malades, guéris et immunisés. Nous disons que tout le monde n'est pas "susceptible".
    Dans les épidémies en cours, le "Taux de reproduction effectif" (R) explique la propagation de la maladie. C'est le nombre d'enfants qui tombent malades dans une classe qui comprend à la fois des enfants qui ne peuvent pas tomber malades et des enfants qui peuvent le faire. (R augmente avec la proportion susceptible. R = R0x, où x est la fraction susceptible)
    Le nombre de personnes susceptibles changera au cours d'une épidémie, à mesure que de plus en plus d'enfants tomberont malades et se rétabliront ou seront vaccinés. Le mélange d'enfants malades, immunisés et guéris peut également ne pas être uniforme.

    Immunité du troupeau

    Si le premier enfant entrait dans une pièce remplie d'enfants immunisés, la maladie ne se propagerait pas. Si presque tous les enfants avaient déjà été malades et étaient immunisés, la maladie ne se propagerait pas. Si 8 enfants sur 10 étaient vaccinés, la maladie ne se propagerait probablement pas. L'enfant malade pourrait ne pas interagir avec les 2 enfants sur 10 qui pourraient tomber malades.
    Nous appelons cela l'immunité du troupeau. En d'autres termes, l'immunité de certains enfants protège d'autres enfants non immunisés contre la maladie. C'est la fraction des enfants qui sont immunisés, de sorte que chaque enfant ne tombe malade que d'un enfant (en moyenne). Si un autre enfant était immunisé, la maladie ne se propagerait pas.
    Si R0 est grand, l'immunité du troupeau ne protège que si beaucoup sont immunisés. (Seuil d'immunité du troupeau = 1 - 1 / R0) Plus le R0 est grand, plus les enfants doivent être vaccinés.

    Super-épandeurs

    Certains enfants propagent plus de maladies que d’autres - comme un enseignant malade qui travaille avec chaque enfant. Les épidémies peuvent être plus compliquées que R0.

    Exemples concrets

    Une des maladies les plus infectieuses est la rougeole avec un R0 entre 12 et 18. Avant la vaccination contre la rougeole, un enfant pouvait infecter 15 enfants dans une classe. Ces 15 camarades de classe pourraient alors chacun infecter 15 camarades de classe. La rougeole se propage rapidement. Pour éviter la propagation de la rougeole, 83 à 95% doivent être vaccinés.
    Nous calculons R0 en observant la rapidité avec laquelle la maladie se propage initialement. Le n R0 d'Ebola est probablement 1,34, 1,86 ou 1,6-2,0. La variole a été éradiquée avec un R0 de 3,5-6 qui nécessitait que 8 sur 10 soient immunisés. La coqueluche a un R0 élevé: 15-17. Tuberculose non traitée 'R0 = 10 alors que la R0 de la grippe est généralement inférieure à 2.
    Nous pouvons également estimer R0 à partir de contacts. Dans une salle de classe, le contact peut être un enfant qui joue aux blocs et qui éternue sur les mains, ce qui propage l'infection. La valeur R0 dépend de ce contact. Cela dépend de la durée de la maladie, du nombre de contacts d'un enfant lorsqu'il est malade, de la fréquence à laquelle une maladie se transmet à chaque contact..