Souches génétiques du VIH-1 et du VIH-2

L’un des principaux obstacles au traitement ou à la mise au point d’un vaccin efficace contre le VIH est la grande diversité génétique du virus lui-même. Alors que les virus qui utilisent l'ADN double brin pour se répliquer sont relativement stables, les rétrovirus comme le VIH reviennent en arrière dans leur cycle de réplication (à l'aide d'ARN à une seule souche) et sont beaucoup moins stables. En conséquence, le VIH est fortement sujet à la mutation par mutation, environ un million de fois plus souvent que les cellules utilisant de l'ADN..
À mesure que la diversité génétique du virus s'élargit et que différents sous-types de virus se transmettent de personne à personne, le matériel génétique mélangé peut créer de nouveaux hybrides du VIH. Alors que la plupart de ces hybrides meurent, les rares survivants présentent souvent une plus grande résistance au traitement contre le VIH et, dans certains cas, une progression plus rapide de la maladie.
La variabilité du VIH crée donc une sorte de "cible mouvante" pour les chercheurs, avec de nouvelles souches recombinantes (génétiques combinées) capables de résister aux agents neutralisants, voire de les éviter. Certaines, comme la souche A3 / 02 identifiée par des chercheurs suédois en 2013, sont capables d'épuiser les défenses immunitaires d'une personne beaucoup plus agressivement que les souches connues jusqu'à présent..
Que sont le VIH-1 et le VIH-2?
Il existe deux types de VIH: VIH-1 et VIH-2. Le VIH-1 est considéré comme le type prédominant, représentant la grande majorité des infections dans le monde, alors que le VIH-2 est beaucoup moins répandu et se concentre principalement dans les régions de l’Afrique de l’Ouest et du Centre. Bien que ces deux types de VIH puissent être à l'origine du sida, le VIH-2 est beaucoup plus difficile à transmettre et beaucoup moins virulent que le VIH-1..
Chacun de ces types de VIH comprend un certain nombre de groupes, sous-types ("clades") et sous-sous-types. Nul doute que d’autres sous-types et souches recombinantes seront découverts au fur et à mesure de la propagation mondiale du VIH..
Groupes et sous-types de VIH-1
Le VIH-1 est divisé en quatre groupes: le groupe M (signifiant "majeur"); Groupe O (signifiant "valeur aberrante" ou au-delà où d'autres groupes sont vus); et groupe N (signifiant "non-M" et "non-O"); et groupe P (signifiant "en attente"). Les quatre groupes différents sont classés en fonction des quatre différents virus de l'immunodéficience simienne (SIV) qui étaient connus pour être transmis des singes ou des chimpanzés à l'homme..
VIH-1 groupe M
Le groupe VIH-1 M a été le premier groupe identifié et représente aujourd'hui environ 90% des cas de VIH dans le monde. On le retrouve pratiquement dans toutes les régions de la planète. Ce groupe comprend 10 sous-types, qui peuvent être stratifiés en fonction, entre autres, de leur répartition géographique et de leur impact sur différents groupes à risque..

• Sous-type A: observé en Afrique de l'Ouest et touchant principalement les hétérosexuels et les consommateurs de drogues injectables (UDI).
• Sous-type B: le sous-type prédominant en Europe, aux États-Unis, au Japon, en Thaïlande et en Australie, représentant la quasi-totalité des infections en Amérique du Nord et environ 80% de toutes en Europe. Les infections surviennent plus chez les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH) et les UDI que chez les hétérosexuels.
• Sous-type C: décrit comme le sous-type de VIH le plus répandu, représentant 48% de toutes les infections dans le monde, principalement hétérosexuelles et principalement en Afrique subsaharienne, en Inde et dans certaines régions de la Chine..   
• Sous-type D: isoler principalement en Afrique orientale et centrale.
• Sous-type E: un sous-type vu uniquement sous une forme recombinante avec le sous-type A.
• Sous-type F: parmi un plus faible pourcentage d'infections observées en Afrique centrale, en Amérique du Sud et en Europe.
• Sous-type G: parmi un plus faible pourcentage d'infections observées dans certaines régions d'Afrique et d'Europe.
• Sous-type H: parmi un plus faible pourcentage d'infections observées en Afrique centrale.
• Sous-type J: observé en Afrique du Nord, centrale et occidentale et dans les Caraïbes

• Sous-type K: limité à la République démocratique du Congo (RDC) et au Cameroun.

VIH-1 groupe O
Le groupe O du VIH-1 a été découvert en 1990 et ne représente que 1% des infections dans le monde. Ce groupe de VIH est isolé au Cameroun et dans les pays africains voisins.
VIH-1 Groupe N
Le groupe N du VIH-1 a été découvert en 1998 et n'a encore été observé qu'au Cameroun, avec moins de 20 cas documentés à ce jour..
VIH-1 groupe P
Le groupe P du VIH-1 est un type rare de VIH, identifié pour la première fois chez une femme du Cameroun en 2009. Il peut se différencier d'un autre groupe de VIH dans la mesure où ses origines ont été liées à une forme de SIV trouvée dans les gorilles occidentaux. Bien que la classification "P" ait été supposée déduire d'un statut "en attente" (c'est-à-dire, en attente de confirmation d'infection supplémentaire), un deuxième cas documenté a été identifié en 2011 chez un Camerounais..
Groupes VIH-2
Bien que des cas de VIH-2 aient été identifiés ailleurs, les infections se produisent presque exclusivement en Afrique. Il existe actuellement huit groupes VIH-2, bien que seuls les sous-types A et B soient les seuls considérés comme épidémiques. On pense que le VIH-2 a croisé des espèces d’un type de SIV affectant la suie mangabeys singe directement à l'homme.
Le groupe A de VIH-2 est principalement observé en Afrique de l’Ouest, bien que les voyages internationaux aient conduit à un petit nombre de cas documentés aux États-Unis, en Europe, au Brésil et en Inde. En revanche, le groupe B du VIH-2 a été confiné à des régions d’Afrique de l’Ouest.