Le VIH est-il moins virulent aujourd'hui ou plus?
La première, menée au Botswana et en Afrique du Sud, suggérait que l'adaptation du virus à certaines variétés de gènes résistants au VIH, appelée antigène leucocytaire B humain (HLA-B), affaiblissait effectivement la capacité du virus à se répliquer, ralentissant ainsi la progression de la maladie. La seconde, qui suivait une cohorte de patients européens sur plusieurs années, portait spécifiquement sur la charge virale moyenne et le nombre de CD4 juste après le stade aigu de l’infection et concluait que, en termes de progression de la maladie seule, le VIH était devenu beaucoup plus virulent avec une rapidité accrue. progression de la maladie.
Comment est-il possible que les deux études se soient terminées avec des interprétations aussi frappantes? S'agit-il simplement d'un plan d'étude douteux, ou est-il possible que la variabilité du virus d'un continent à l'autre - ou même d'un pays à l'autre - ait conduit les équipes de scientifiques dans des directions complètement opposées??
Mesurer la virulence du VIH au Botswana et en Afrique du Sud
Dans la première étude, des scientifiques de l'université d'Oxford, dirigés par l'investigatrice principale Rebecca Payne, se demandaient si la présence de certains gènes HLA-B, fortement associée à une progression plus lente de la maladie et à un meilleur contrôle viral, aurait pu induire des mutations du VIH susceptibles d'affaiblir ses gènes "fitness viral."Des recherches antérieures avaient montré que certaines populations avaient un pourcentage plus élevé d'individus porteurs de cette mutation rare, résistante au VIH, allant de 75% au Japon à 20% en Afrique du Sud. En examinant la disparité, les enquêteurs ont commencé à se demander si cela pouvait contribuer, en partie, aux immenses différences entre les pays à faible prévalence tels que le Japon et les régions à prévalence extrême telles que l'Afrique subsaharienne..
Les taux de VIH restant relativement bas au Japon, les chercheurs ont axé leurs recherches sur une cohorte de patients du Botswana, pays dans lequel l’épidémie de VIH a atteint son apogée en 2000, et l’a comparé à une cohorte correspondante en Afrique du Sud, qui n’a son apogée en 2010.
L'enquête initiale a révélé que la charge virale moyenne des patients non traités au Botswana, où la maladie est "plus âgée", était bien inférieure à celle de l'Afrique du Sud, où la maladie est "plus jeune" de dix ans (15 350 copies / ml contre 29 350 copies / mL, respectivement). En outre, malgré un nombre de CD4 inférieur de 50 cellules / ml à celui de l'Afrique du Sud, les Botswanais vivant avec le VIH avaient tendance à vivre plus longtemps, ce qui suggère un sous-type moins virulent..
Avec cette preuve en main, les enquêteurs ont ensuite examiné la structure génétique du VIH des patients et ont découvert qu'un nombre plus élevé de Botswanais avaient une mutation "échappée" du HLA-B (ce qui signifie que le virus s'était adapté à la présence de la molécule HLA échapper à la détection). Ce faisant, les scientifiques ont estimé que la "qualité" du virus pouvait être affaiblie, ce qui ralentissait sa capacité de réplication ainsi que sa capacité à endommager le système immunitaire du patient..
Au total, 46% de la cohorte Botswanaise avaient des mutations clés de HLA-B, contre seulement 38% des Sud-Africains. Les dosages en éprouvette semblent corroborer cette hypothèse, le VIH provenant de l'échantillon du Botswana se reproduisant 11% plus lentement que celui de l'Afrique du Sud..
Sur la base de données statistiques provenant de cliniques prénatales, Payne et son équipe ont également suggéré que la virulence du VIH avait commencé à s'estomper en Afrique du Sud également, la charge virale moyenne des femmes non traitées diminuant de 13 550 en 2002-2005 à 5 750 en 2012- 2013.
Mesurer la virulence du VIH dans la cohorte européenne CASCADE
L’étude européenne a adopté une approche beaucoup plus simple et réaliste, dans laquelle les données des patients de la cohorte paneuropéenne CASCADE, établie de longue date, ont été analysées de 1979 à 2002. Dans leur recherche, les investigateurs de CASCADE se sont concentrés sur deux facteurs clés:- le nombre moyen de CD4 après la séroconversion (qui détermine à quel point l’infection par le VIH a affaibli le système immunitaire d’une personne), et;
- le "point de consigne" viral moyen (où la charge virale se stabilise après le stade aigu de l'infection, les charges virales plus élevées étant généralement liées à une progression plus rapide de la maladie).
Encore plus inquiétant était la vitesse à laquelle la maladie semblait progresser année après année chez les personnes vivant avec le VIH. Selon les recherches, le temps moyen nécessaire pour que le nombre de CD4 d'un patient passe en dessous de 350, stade recommandé pour le traitement antirétroviral, est passé de sept ans en 1979 à seulement 3,4 ans en 2002..
Différences clés dans la recherche
Les deux types de recherche ont finalement leurs limites, avec des plans d’étude susceptibles de susciter un débat parmi les scientifiques et les décideurs. Parmi les principales différences:- Bien que l'étude africaine ait examiné les données statistiques de plus de 2 000 patients au Botswana et en Afrique du Sud, le nombre réel de patients inclus dans l'échantillon de capacité de réplication était non seulement faible (16 en Afrique du Sud et 63 au Botswana), mais pris à un moment donné. . En revanche, près de 16 000 patients ont été inclus dans la cohorte CASCADE, qui ont tous été étudiés sur des périodes beaucoup plus longues..
- Bien que Payne et son équipe se soient concentrés sur l'impact des mutations induites par HLA sur la charge virale d'un patient, ils n'ont pas pu montrer que la présence de ces mutations avait un impact quelconque sur l'épuisement des CD4. En revanche, les chercheurs de CASCADE ont considéré que la dynamique CD4 / charge virale était essentielle pour établir la virulence du VIH. Ils ont également limité l'inclusion aux seuls patients qui avaient été diagnostiqués dans les trois mois suivant l'infection, fournissant ainsi un point de départ plus clair pour mesurer la progression de la maladie / l'épuisement des cellules CD4..
- Cependant, il est important de noter que l'équipe CASCADE n'a effectué que des analyses de sensibilité sur les hommes blancs et homosexuels (afin de mieux garantir les points communs dans l'historique du traitement et le sous-ensemble viral). Bien que l'analyse suggère que la virulence pourrait se stabiliser en Europe dans son ensemble, la charge virale de la communauté passant de 31 000 en 2002 à 25 500 en 2008, il n'en va pas de même pour les hommes homosexuels. Comme on sait que la propagation rapide du VIH au sein de la population masculine homosexuelle (parallèlement à des niveaux plus élevés d’exposition au traitement) a entraîné une plus grande diversité génétique et une résistance transmise, il est possible que le sous-ensemble viral affectant ce groupe soit en réalité plus complexe. virulent.
- En revanche, l’étude africaine a été menée dans des pays où les rapports hétérosexuels étaient non seulement le principal mode de transmission, mais où, jusqu’à récemment, beaucoup moins de personnes étaient exposées au traitement anti-VIH. En conséquence, la diversité génétique du VIH en Afrique australe est considérée comme bien inférieure, certaines recherches suggérant que la variabilité régionale du virus pourrait permettre de profondes différences de virulence du VIH..
